مقام های دولتی در شهر بخارا مانع از به ثمر رسیدن تلاش های شیعیان برای بازگشایی مساجد در این شهر به بهانه های مختلف شده اند.
پیروان مكتب اهل بیت ع در سراسر ازبكستان فقط چهار مسجد ثبت شده در بخارا و سمرقند دارند
ظرفیت این مساجد برای تأمین تقاضای نمازگزاران كافی نیست و مسلمانان در جشن های مذهبی مجبور به تجمع در خیابان ها هستند.
این در حالی است كه در منطقه بخارا ، هفت مسجد متعلق یه شیعیان از اوایل دهه ۱۹۹۰ تا سال ۲۰۰۸ فعالیت داشتند كه مقامات همه آنها را به جز دو مسجد تعطیل كردند.
